На каком основании работодатель может отказать в трудоустройстве, ели нет постоянной прописки в том регионе в котором фактически проживаю, но являюсь гражданкой РФ?
В соответствии со ст. 64 ТК РФ, запрещается необоснованный отказ в заключении трудового договора. Какое бы то ни было прямое или косвенное ограничение прав или установление прямых или косвенных преимуществ при заключении трудового договора в зависимости от места жительства (в том числе наличия или отсутствия регистрации по месту жительства или пребывания) не допускается.
Прочитать более подробно о том, что такое дискриминация и как с ней бороться, Вы можете тут http://trudprava.ru/?id=1424&expmids=%7B62%7D%7B64%7D